免疫沉淀實驗不同于WB實驗的樣品制備,對實驗樣品制備要求更高,除了要控制所有操作盡量在冰上完成外,關鍵的是裂解液的成分,裂解液成分直接決定了樣品質量。
主要影響:
1. 蛋白的釋放:許多目的蛋白定位在細胞器,質膜,細胞核,細胞骨架中,但通常這些亞細胞結構很難被裂解液有效溶解,所以很難將這些蛋白釋放出來。
2. 蛋白相互作用:不同去垢劑對不同性質的蛋白質間相互作用影響程度不同,一些互作較弱的蛋白對盡管在比較溫和的裂解液配方中仍然會被破壞。
免疫沉淀選瓊脂糖珠還是磁珠?溫州ChIP免疫沉淀外包公司
免疫沉淀實驗中磁珠還是瓊脂糖珠的選擇取決于客戶實驗情況。
瓊脂糖珠海綿狀的結構 (直徑 50-150 μm) 可以結合抗體 (繼而結合靶蛋白) ,它能夠直接高效、快速結合抗體,而不需借助特殊的專業(yè)設備。瓊脂糖珠呈多孔結構,這使得它們擁有更大的表面積可與蛋白質相互接觸,具有更高的結合載量。
與瓊脂糖珠不同,磁珠是固體,抗體的結合限于磁珠的表面。磁珠 (直徑 1-4 μm) 明顯小于瓊脂糖珠 ,盡管磁珠沒有多孔中心增加結合能力,但每體積的磁珠數(shù)量比瓊脂糖珠多,使磁珠擁有足夠的抗體結合表面積滿足高容量的抗體結合。
簡而言之,瓊脂糖珠的結合能力較強,而磁珠在得率,可重復性以及自動化方面有明顯的優(yōu)勢。
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免疫沉淀是利用抗體特異性反應純化富集目的蛋白的一種方法??贵w與細胞裂解液或表達上清中相應的蛋白結合后,再與蛋白A/G(ProteinA/G)或二抗偶聯(lián)的珠子(agarose或Sepharose)孵育,通過離心得到珠子-蛋白A/G或二抗-抗體-目的蛋白復合物,沉淀經過洗滌后,重懸于電泳上樣緩沖液,煮沸5-10min,在高溫及還原劑的作用下,抗原與抗體解離,離心收集上清,上清中包括抗體、目的蛋白和少量的雜蛋白。免疫沉淀是一種生物學技術,它利用抗體的特異性結合特性來富集和分離混合物中的特定蛋白質。這種技術是研究蛋白質表達、蛋白質-蛋白質相互作用、蛋白質修飾和蛋白質功能的強大工具。
Co-IP(免疫共沉淀)技術主要用于研究蛋白質之間的相互作用,其應用場景如下:
1. 蛋白質相互作用網絡的鑒定:Co-IP可用于構建蛋白質相互作用網絡,發(fā)現(xiàn)目標蛋白的結合伙伴。
2. 信號傳導途徑的研究:通過Co-IP技術,科學家們發(fā)現(xiàn)了許多關鍵的細胞信號通路,如MAPK和PI3K/Akt通路等,為深入理解這些通路的功能和調控機制提供了重要線索。
3. 藥物靶點篩選:利用Co-IP技術,研究人員可以篩選潛在的藥物靶點。
疾病機制研究:通過分析疾病相關蛋白質的相互作用,Co-IP有助于揭示疾病的分子機制。
4. 抗體藥物開發(fā):Co-IP可用于研究抗體藥物與其靶標蛋白的結合特性,評估抗體藥物的親和力和特異性。
5. 轉錄因子研究:Co-IP技術可以用于研究轉錄因子與蛋白質的相互作用,進而揭示基因調控網絡。
免疫沉淀樣本的制備。
Co-IP的實驗步驟:
1. 細胞裂解:首先,細胞或組織被裂解,釋放其中的蛋白質。
2. 抗體結合:然后,將特異性抗體(針對已知蛋白質之一的抗體)加入到裂解物中。這些抗體會特異性地結合到目標蛋白(誘餌蛋白)上。
3. 免疫復合物形成:抗體與目標蛋白結合后,形成免疫復合物。
4. 沉淀:接著,使用蛋白A或蛋白G結合的珠子(如瓊脂糖或磁性珠子)來捕獲免疫復合物。蛋白A或蛋白G能夠與抗體的Fc部分結合,從而拉下抗體以及與之結合的目標蛋白和任何相關的相互作用蛋白。
5. 洗滌:捕獲的免疫復合物被洗滌以去除未特異性結合的蛋白質。
6. 洗脫和分析:免疫復合物被洗脫并進行進一步的分析,如Western blot(WB)或質譜分析,以鑒定相互作用的蛋白質。
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免疫沉淀RIP抗體的選擇?溫州ChIP免疫沉淀外包公司
免疫沉淀技術作為現(xiàn)物學研究中的重要工具,為揭示細胞內復雜的生物分子相互作用提供了關鍵的方法。該技術的重點原理是基于抗原與抗體的特異性結合。通過使用特異性的抗體,能夠從細胞裂解液或復雜的生物樣本中捕獲目標蛋白質及其與之相互作用的分子復合物。這種特異性的捕獲使得我們能夠分離和研究那些在細胞內原本難以捉摸的蛋白質相互作用。在研究蛋白質-蛋白質相互作用方面,免疫沉淀技術發(fā)揮著不可替代的作用。它可以幫助確定在特定生理或病理條件下,哪些蛋白質會形成復合物共同發(fā)揮功能。這對于理解細胞信號轉導通路、基因表達調控以及疾病的發(fā)生機制具有重要意義。此外,免疫沉淀技術還能夠用于研究蛋白質的翻譯后修飾,如磷酸化、甲基化等。通過特異性抗體識別修飾后的蛋白質,進而分析其修飾狀態(tài)和相關的相互作用,為深入探究蛋白質的功能調控提供了有力的支持。溫州ChIP免疫沉淀外包公司