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重慶新型高通量篩選

來源: 發(fā)布時間:2022-07-09

開發(fā)一種新藥的過程可能是漫長、復雜和不確定的,但從社會、科學和經(jīng)濟的角度來看,它也可能是高回報的。高通量篩選(HTS)已經(jīng)成為藥物發(fā)現(xiàn)的主要工具。,向大家介紹目前用于靶標確認的幾種HTS方法,主要分為兩大類:生化水平和細胞水平。生化水平分析包括比率熒光法(FA/FP)、熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)、時間分辨熒光共振能量轉(zhuǎn)移(TR-FRET)等;細胞水平的分析包括細胞活力、報告基因、第二信使和高內(nèi)涵成像等。生化篩選利用純化的目標蛋白,在體外測定配體的結(jié)合或酶活性的抑制。這些檢測通常在384孔板中以競爭的形式進行,其中所研究的化合物必須取代已知的配體或底物。熒光法由于其使用簡便、靈敏度高和靈活性強等特點,廣受科研人員的歡迎,主要有比率熒光法(FA/FP)、熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)、時間分辨熒光共振能量轉(zhuǎn)移(TR-FRET)。高通量篩選的原理是什么。重慶新型高通量篩選

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正如之前提到,在高通量篩選中Assay的檢出方法有很多,用于衡量酶活性多的當屬于熒光檢出法和吸光度檢出法。這兩種方法都能非常便捷的與高通量進行匹配。但是這兩種檢出方法也有不適用的場景,比如吸光度檢出法,在終點法測定(endpointassay)時,如果化合物庫的吸收低于~410nm,實驗的背景吸收會引入假陽性(false-positive)和假陰性(false-negative)結(jié)果。雖然假陽性結(jié)果可以通過動力學Assay或者驗證Assay來解決,但是由于微量定量板有位于340~410nm的強吸收,所以仍舊會導致Z因子降低,直接結(jié)果就是較弱活性的苗頭化合物將很難被篩選出來。而對于熒光檢出法而言,自發(fā)熒光化合物庫或者具有光敏特性的化合物庫同樣會遇到假陽性和假陰性結(jié)果。在某種程度上,選擇合適的檢出方法可以減少甚至避免上述問題,比如使用更長波段的光源,對于熒光檢出來說,>500nm會是比較好的選擇。上海霉菌高通量篩選高內(nèi)涵高通量篩選系統(tǒng)。

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高通量篩選作為主流的篩選技術(shù),已得到了的應(yīng)用。其他篩選技術(shù),比如組合庫(CombinatorialLibrary)和碎片化合物庫(FragmentLibrary)篩選技術(shù)運用也相當,只是相較而言運用較少。另外,基于DNA編碼化合庫(DEL)技術(shù)的篩選文獻報道也不多見,并且大都發(fā)表于2016年之后,很多研究工作仍處于待發(fā)表狀態(tài)。正如2018年Brown和Bostr?m所指出,TheJournalofMedicinalChemistry上所報道的66個臨床化合物,就有1個是出自于DNA編碼化合物庫技術(shù)。

離子通道是目前藥物發(fā)現(xiàn)的重要靶點。例如在心血管疾病中,離子通道檢測可以應(yīng)用于原發(fā)性電障礙(長QT綜合癥、短QT綜合癥、Brugada綜合癥)等方面的藥物篩選。以NovelKCNQ2channelactivatorsdiscoveredusingfluorescence-basedandautomatedpatch-clamp-basedhigh-throughputscreeningtechniques一文為例,通過一種改進的高通量篩選技術(shù),篩選新型KCNQ2通道劑。在這篇文獻中,作者團隊以ZTZ240(KCNQ2通道劑)作為陽性對照,通過鉈通量測定法從80000種化合物篩選出了565個比ZTZ240更強活性的化合物。然后使用384孔自動化膜片鉗,進一步篩選出了38個KCNQ2通道劑。,使用傳統(tǒng)的膜片鉗表征劑,得到ZG1732和ZG2083(EC50分別為1.04μM和1.37μM)。高通量篩選微生物技術(shù)。

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熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)是指在兩個不同的熒光基團中,如果一個熒光基團(供體Donor)的發(fā)射光譜與另一個基團(受體Acceptor)的吸收光譜有一定的重疊,當這兩個熒光基團間的距離合適時,就可觀察到熒光能量由供體向受體轉(zhuǎn)移的現(xiàn)象,即以前一種基團的激發(fā)波長激發(fā)時,可觀察到后一個基團發(fā)射的熒光。常見的供體-受體對之間的有效距離通常為2-6nm,適用于許多蛋白質(zhì)相互作用。染料通常是有機分子,如與蛋白質(zhì)偶聯(lián)的熒光素和羅丹明,或與感興趣的蛋白質(zhì)融合的熒光蛋白。高通量篩選的藥物特點。重慶新型高通量篩選

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然而傳統(tǒng)的針對單一靶點的研究方法已經(jīng)難以適應(yīng)一些多基因疾病和病毒等相關(guān)藥物的研究。而基于細胞水平的高內(nèi)涵篩選(high content screening, HCS)技術(shù)實現(xiàn)了對化合物多靶點多參數(shù)的同時檢測,從疾病相關(guān)基因調(diào)控通路和網(wǎng)絡(luò)水平上研究藥物的作用機制、代謝途徑和潛在毒性等,也使在細胞水平評價活性化合物的成成為可能。從篩選載體上看,HCS和HTS并沒有的區(qū)別,它的檢測體積并未因檢測指標增加而增高,操作步驟同樣簡單可行、可自動化。故HCS在新藥研發(fā)中發(fā)揮越來越重要的作用。重慶新型高通量篩選